Решил набросать свой вариант, как можно было бы изменить маршруты в Люберцах и граничащими с Люберцами других городов и округов:
Социальные маршруты:
Маршрут №1 (МЦД Люберцы - Торговый центр - МЦД Люберцы) - оставить без изменений;
Маршрут №2 (МЦД Люберцы - 115-й квартал - МЦД Люберцы) - изменить, предложение - сделать заезд через метро Котельники, отменить при этом дублирующий маршрут №354 (измененная трасса на карте - https://clck.ru/3Ddpck);
Маршрут №2Б (МЦД Люберцы - Городок Б) - оставить без изменений;
Маршрут №4 (МЦД Люберцы - ул. Космонавтов) - продлить до МЦД Панки, отменить при этом дублирующий маршрут №5 (измененная трасса на карте - https://clck.ru/3Ddpny);
Маршрут №5 (МЦД Люберцы - МЦД Панки) - отменить, причина - изменение маршрута №4;
Маршрут №7 (МЦД Люберцы - Проспект Гагарина - МЦД Люберцы) - оставить без изменений;
Маршрут №11 (Проспект Гагарина - м. Котельники) - изменить, продлить до Микрорайона Красная Горка (измененная трасса на карте - https://clck.ru/3DdqB3);
Маршрут №20 (МЦД Люберцы - Площадь Святителя Николая) - оставить без изменений;
Маршрут №21 (МЦД Люберцы - Лес) - оставить без изменений;
Маршрут №22 (МЦД Люберцы - Островцы - Автостанция Лыткарино) - оставить без изменений;
Маршрут №25 (МЦД Люберцы - 6-й микрорайон) - оставить без изменений;
Маршрут №26 (МЦД Люберцы - Микрорайон Силикат - МЦД Люберцы) - изменить, предложение - сделать заезд через метро Котельники, отменить при этом дублирующий маршрут №474 (измененная трасса на карте - https://clck.ru/3DdqDg);
Маршрут №27 (МЦД Люберцы - Белая Дача) - изменить, предложение - одностороннем кольцом сделать заезд через метро Котельники и ЖК Оранж Парк, отменить при этом дублирующий маршрут №475 (измененная трасса на карте - https://clck.ru/3DdqJF);
Маршрут №29 (Автостанция Лыткарино - МЦД Томилино) - основную версию до Автостанции Лыткарино оставить без изменений, добавить короткую версию от МЦД Томилино до ЖК Томилино Парк (трасса короткой версии на карте - https://clck.ru/3DdqVi);
Маршрут №31 (МЦД Люберцы - д. Мотяково) - изменить, измененная трасса: Инициативная улица, 2-я Вольская улица, Микрорайон Красная Горка, Наташинская улица, Проспект Гагарина, Проспект Победы, проспект Защитников Москвы, Покровская улица, Рождественская улица, далее - своим привычным маршрутом до ЖК Коренёвский Форт-2.2, убрать версию 31П в связи с дублирующим маршрутом №1225 (измененная трасса на карте - https://clck.ru/3DdqZN);
Маршрут №41 (МЦД Люберцы - Новолюберецкое кладбище - МЦД Люберцы) - оставить без изменений;
Маршрут №78 (ул. Барыкина - Поликлиника (ул. Толстого)) - изменить, продлить до м. Лухмановская (измененная трасса на карте - https://clck.ru/3Ddqcx) (P.S. на Лухмановской скоро как раз откроется новый отстой на ул. 8-го марта);
Маршрут №305 (Площадь Святителя Николая - м. Люблино) - оставить без изменений;
Маршрут №323 (Октябрьский - м. Лермонтовский проспект) - оставить без изменений и убрать короткую версию до МЦД Томилино;
Маршрут №346 (Коренёво - м. Лермонтовский проспект) - изменить, продлить до пос. Балластный Карьер (измененная трасса на карте - https://clck.ru/3DdqgN) (P.S. компенсация отмены коммерческой маршрутки 546к);
Маршрут №347 (Областная больница - м. Котельники) - отменить, причина - дублирующие маршруты №20, 21, 470, 904;
Маршрут №348 (6-й Микрорайон - м. Котельники) - все версии оставить без изменений, добавить новый короткий маршрут от ЖК Томилино Парк до м. Котельники, трасса нового короткого маршрута: Рязанская улица, улица Академика Северина, улица Свободы, улица Академика Северина, Лыткаринское шоссе, Новорязанское шоссе (трасса нового короткого маршрута на карте - https://clck.ru/3Ddt7C);
Маршрут №351 (ЖК Ольховка - МЦД Отдых) - изменить, вернуть маршрут к м. Котельники;
Маршрут №352 (115-й квартал - м. Лермонтовский проспект) - оставить без изменений;
Маршрут №354 (Гарнизон - м. Котельники) - отменить, причина - изменение маршрута №2;
Маршрут №373 (ул. Южная - м. Лермонтовский проспект) - оставить без изменений;
Маршрут №424 (МЦД Раменское - м. Котельники) - отменить, причина - альтернатива в виде МЦД, дублирующий маршрут №39 (МЦД Раменское - Аэропорт Быково);
Маршрут №431 (Улица 8-го Марта - м. Котельники) - изменить, убрать оттянутую трассу через ул. Кирова и сделать заезд через МЦД Люберцы (измененная трасса на карте - https://clck.ru/3Ddqu7);
Маршрут №441 (Аэропорт Жуковский - м. Котельники) - оставить без изменений;
Маршрут №453 (МЦД Люберцы - МЦД Ухтомская) - отменить, причина - дублирование маршрутов №722, №723, №726 - Мосгортранс);
Маршрут №463 (ул. Февральская - м. Лермонтовский проспект) - оставить без изменений;
Маршрут №470 (Областная больница - м. Котельники) - оставить без изменений;
Маршрут №474 (Микрорайон Силикат - м. Котельники) - отменить, причина - изменение маршрута №26;
Маршрут №474к (Карьер - м. Котельники) - отменить, причина - изменение маршрута №26;
Маршрут №475 (Белая Дача - м. Котельники) - отменить, причина - изменение маршрута №27;
Маршрут №478 (Площадь Громова - м. Котельники) - оставить без изменений;
Маршрут №501 (Таможенная академия - м. Выхино) - изменить, сократить до м. Лухмановская;
Маршрут №904 (Областная больница - м. Котельники) - изменить, измененная трасса: Дзержинская улица, Лесная улица, Угрешская улица, Угрешский проезд, улица Промзона Силикат, Железнодорожная улица, Яничкин проезд, Новоегорьевское шоссе, Новорязанское шоссе (измененная трасса на карте - https://clck.ru/3Ddr4r);
Маршрут №1063 (Университет Угреша - м. Алма-Атинская) - оставить без изменений;
Маршрут №1064 (Микрорайон Красная Горка - МЦД Реутов) - оставить без изменений;
Маршрут №1225 (Школа - м. Новокосино) - изменить, измененная трасса: Вертолётная улица, улица Барыкина, Зенинское шоссе, Зенинское шоссе, улица Вертолётчиков, улица Липчанского, Рождественская улица, Покровская улица, Проектируемый проезд № 598, улица 8 Марта, Красковская улица, Лухмановская улица, улица Руднёвка, Салтыковская улица, Городецкая улица, Южная улица (через метро Некрасовка и продлить до МЦД Реутов) (измененная трасса на карте - https://clck.ru/3DdsHu);
Маршрут №1225 (Школа - м. Некрасовка) - отменить, причина - дублирование маршрута №1232;
Маршрут №1225 (Улица Барыкина - Улица Барыкина) - изменить, измененная трасса: улица Барыкина, Вертолётная улица, Каштановая улица, 2-я Вольская улица, Покровская улица, проспект Защитников Москвы, Комсомольский проспект, Инициативная улица, 2-я Вольская улица, Каштановая улица, Вертолётная улица, улица Барыкина (измененная трасса на карте - https://clck.ru/3DdsNb);
Маршрут №1225 (Школа - Школа) - отменить, причина - дублирование других версий маршрута №1225 и маршрута №1232;
Маршрут №1232 (Школа - м. Выхино) - изменить, сократить до м. Лухмановская
P.S. некорректно было бы приводить в пример коммерческие маршруты, т.к. это "другая история" :)